Учреждение имеет следующие структурные подразделения: 

• - административно-хозяйственная часть, медицинский персонал; 

• - отделение первичного приема, мониторинга и инновационных технологий; 

• - отделение дневного пребывания; 

• - отделение социальной психолого-педагогической помощи семье и детям; 

• - отделение профилактики детского неблагополучия, реализации социальных семьесберегающих технологий; 

• - консультативный пункт «Семья»; 

• - филиал государственного бюджетного учреждения Калужской области «Боровский центр социальной помощи семье и детям «Гармония» в г. Балабаново «Социально-реабилитационный центр для несовершеннолетних «Ориентир»; 

• - филиал государственного бюджетного учреждения Калужской области «Боровский центр социальной помощи семье и детям «Гармония» в г. Ермолино «Центр социальной помощи семье и детям «Семья»; 

• - филиал государственного бюджетного учреждения Калужской области «Боровский центр социальной помощи семье и детям «Гармония» в дер. Митяево «Социальный приют для детей и подростков «Забота». 

Каждое структурное подразделение Учреждения возглавляет заведующий, назначаемый и освобождаемый от должности приказом директора Учреждения.